El Plan de Desarrollo Institucional se renueva cada cuatro años, y fija políticas y directrices sobre la renovación, mantenimiento, fortalecimiento y actualización de la infraestructura física y virtual de la Universidad de Cartagena, las cuales garantizan el desarrollo de las funciones sustantivas y de bienestar. En la actualidad, la Institución cuenta con un Sistema Integrado de Gestión denominado SIGUC, que integra el Sistema de Aseguramiento de la Calidad, el Sistema de Gestión de la Calidad y Control Interno.

Esta integración de los sistemas ha permitido articular los esfuerzos bajo la gestión por procesos, haciendo inherentes las distintas etapas del proceso de mejora continua bajo un ciclo PHVA. El grado de madurez alcanzado conduce al sostenimiento de la certificación de calidad de los procesos bajo la Norma ISO 9001 ―otorgada por primera vez en el año 2011―. En este sentido, la Universidad de Cartagena se ha convertido en un referente de calidad de la educación superior en Colombia, logrando posicionarse como la universidad pública líder del
Caribe colombiano y con una trayectoria de más de 40 años de cultura de calidad institucional.